Когда кажется, что худшее позади, начинается настоящая охота. Эдди и Веном скрываются от властей, которых сбила с толку гибель Маллигана, но за ними уже следуют новые, куда более жуткие враги. Ксенофаги, древние симбиотические существа, не знают жалости — они выполняют волю своего хозяина, могущественного Налла. Этот прародитель симбиотов, закованный в космическую темницу, отправляет армию, чтобы вернуть себе Венома и пробудиться вновь.
Внутри Венома спрятан таинственный артефакт — Кодекс, ключ к освобождению Налла. Но если погибнет хотя бы один из носителей, Кодекс исчезнет навсегда. Эдди и Веном вынуждены скрываться сразу от трёх сторон: межгалактических охотников, военных из Зоны 51 и земных спецслужб. Их враги сильны, ресурсы ограничены, и главное оружие — верность друг другу. В этом фильме герои выходят за пределы своей истории и вступают в игру, где на кону не просто выживание, а баланс всей галактики.